Estonia cuenta con más de 2300 lagos con una superficie superior a una hectárea. En conjunto cubren más de 2100 km2, aproximadamente el 4,8% del territorio de Estonia. La mayor parte del área total de los lagos corresponde al lago Peipus-Pskov, al lago Võrtsjärv y al embalse de Narva. Los lagos pequeños, por su parte, representan solo 176 km2, o el 8,5%. La mayoría de los lagos naturales de Estonia son de origen glaciar.
| Nombre | Área (ha) |
|---|---|
| Lake Peipsi-Pskov | 354307.0 |
| Lake Võrtsjärv | 26919.1 |
| Narva Reservoir | 10587.9 |
| Lake Ülemiste | 944.4 |
| Lake Saadjärv | 723.5 |
| Great Bay | 539.5 |
| Lake Vagula | 603.3 |
| Lake Veisjärv | 480.7 |
| Lake Ermistu | 449.5 |
| Paunküla Reservoir | 420.2 |
| Nombre | Profundidad (m) | Área (ha) |
|---|---|---|
| Lake Rõuge Suurjärv | 38 | 13.5 |
| Lake Väike-Palkna | 31.9 | 4.5 |
| Lake Udsu | 30.2 | 6.2 |
| Lake Tsolgo Mustjärv | 29.7 | 6 |
| Lake Uhtjärv | 27.6 | 43.5 |
| Lake Keema Suurjärv | 27.5 | 3.9 |
| Lake Koorküla Valgjärv | 26.8 | 44.1 |
| Lake Pindi Kärnjärv | 26 | 8.3 |
| Lake Jõksi | 25.4 | 64.9 |
| Lake Piigandi | 25.3 | 43.4 |
| Lake Saadjärv | 25 | 710 |
| Lake Vellavere Külajärv | 25 | 3.6 |
| Lake Petajärv | 25 | 3.6 |
El lago más grande de Estonia en la tabla es el lago Peipus-Pskov.
El lago más profundo de la tabla es el lago Rõuge Suurjärv, con 38 metros de profundidad.
Muestra el nombre del lago y su área, y en la segunda tabla también la profundidad.
La mayoría de los lagos naturales de Estonia son de origen glaciar.